Herramienta de complemento reverso de ADN
Pega una secuencia de ADN o ARN, simple o en FASTA con uno o varios registros, y obtén al instante su complemento reverso, su complemento o su reverso. Los códigos de ambigüedad IUPAC, los huecos y las mayúsculas/minúsculas se tratan correctamente.
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Vista de cadenas
Cómo usar Herramienta de complemento reverso de ADN
- Pega tu secuencia en el cuadro de entrada. Funcionan la secuencia simple, el texto numerado de GenBank o FASTA con uno o varios registros.
- Elige la operación: Complemento reverso (la cadena opuesta leída 5'→3'), Complemento o Reverso.
- Elige las opciones de salida: letras de ADN o ARN, ancho de línea y si se añade una nota a los encabezados FASTA.
- Revisa los avisos. Los caracteres inusuales se muestran con sus posiciones para que detectes errores tipográficos.
- Copia o descarga el resultado como archivo .fasta.
Cómo se calcula el complemento reverso
El ADN es una doble hélice de dos cadenas antiparalelas. Cada base se empareja con una pareja fija: adenina (A) con timina (T), o uracilo (U) en el ARN, y guanina (G) con citosina (C). Como las cadenas van en direcciones opuestas, la cadena pareja de 5'-ATGCC-3' es 3'-TACGG-5'. Las secuencias siempre se escriben 5'→3', así que esa cadena se escribe al revés como 5'-GGCAT-3'. Ese es el complemento reverso.
- Complemento: cambia cada base por su pareja y mantiene el orden. Es la otra cadena escrita 3'→5'.
- Reverso: mantiene las bases pero las lee al revés. Es la misma cadena escrita 3'→5'. Rara vez se necesita en biología, pero es útil para comprobar palíndromos y leer electroferogramas.
- Complemento reverso: complementa e invierte. Úsalo para diseñar cebadores reversos, leer la cadena negativa de un gen o comprobar si una secuencia coincide con la cadena opuesta de una referencia.
Códigos de nucleótidos IUPAC y sus complementos
| Código | Significado | Bases | Complemento |
|---|---|---|---|
| A | Adenina | A | T (U en ARN) |
| C | Citosina | C | G |
| G | Guanina | G | C |
| T / U | Timina / Uracilo | T o U | A |
| R | Purina | A o G | Y |
| Y | Pirimidina | C o T | R |
| S | Fuerte (3 puentes de H) | G o C | S |
| W | Débil (2 puentes de H) | A o T | W |
| K | Ceto | G o T | M |
| M | Amino | A o C | K |
| B | No A | C, G o T | V |
| D | No C | A, G o T | H |
| H | No G | A, C o T | D |
| V | No T | A, C o G | B |
| N | Cualquier base | A, C, G o T | N |
| - o . | Hueco | ninguno | se mantiene como hueco |
Consejos para trabajar con secuencias
- Cebadores reversos: para crear un cebador reverso que se una al final de tu diana, toma las últimas 18–25 bases de la cadena superior de la diana y usa su complemento reverso. Comprueba su temperatura de fusión con la Calculadora de Tm de cebadores.
- Palíndromos: muchos sitios de restricción son su propio complemento reverso. El sitio de EcoRI, GAATTC, por ejemplo, se lee igual en ambas cadenas.
- Enmascaramiento suave: los archivos de genomas suelen marcar las repeticiones en minúsculas. Mantén la opción "Mantener como se escribió" para que el enmascaramiento quede donde corresponde.
- Traducir la cadena negativa: los tres marcos de lectura reversos de una secuencia son los marcos directos de su complemento reverso. El Traductor de ADN a proteína muestra los seis marcos a la vez.
Preguntas frecuentes
¿Qué es un complemento reverso?
Es la secuencia de la cadena opuesta de ADN, escrita en la dirección normal 5' a 3'. Cambias cada base por su pareja (A con T, C con G) y luego lees el resultado al revés. Para 5'-ATGCC-3' el complemento reverso es 5'-GGCAT-3'.
¿Por qué necesito el complemento reverso y no solo el complemento?
Las cadenas de ADN son antiparalelas. El complemento simple se escribe 3' a 5' bajo la original, pero las secuencias siempre se escriben 5' a 3', así que también hay que invertirlo. Los cebadores reversos, las sondas en la cadena negativa y los genes en la cadena reversa se escriben como complementos reversos.
¿Cómo se complementan los códigos de ambigüedad IUPAC?
Cada código representa un conjunto de bases y se convierte en el código del conjunto complementario: R (A/G) ↔ Y (C/T), K (G/T) ↔ M (A/C), B (no A) ↔ V (no T), D (no C) ↔ H (no G). S (G/C), W (A/T) y N (cualquier base) son su propio complemento.
¿Funciona con ARN?
Sí. La U se trata como pareja de la A. Si la entrada contiene U y no T, la salida usa U automáticamente, o puedes forzar la salida en ADN (T) o ARN (U) con la opción Letras de salida.
¿Puedo pegar un archivo FASTA con varias secuencias?
Sí. Cada registro se procesa por separado, se conservan los encabezados y las líneas de secuencia se vuelven a ajustar al ancho que elijas. Opcionalmente puedes añadir una nota como "complemento reverso" a cada encabezado.
¿Qué pasa con los números, los espacios y las minúsculas?
Los números, espacios y saltos de línea se eliminan, así que las secuencias copiadas de GenBank o de un editor de texto funcionan directamente. Las minúsculas se mantienen, lo que conserva las regiones repetidas con enmascaramiento suave. Los huecos (- y .) se mantienen en su sitio.
¿Se sube mi secuencia a algún sitio?
No. La conversión se ejecuta por completo en tu navegador con JavaScript; no se envía nada a ningún servidor.
¿Se prueban todas las herramientas de FreeToolCabin para comprobar su calidad y precisión?
Sí. Cada herramienta del sitio pasa pruebas automáticas en navegadores reales para comprobar que el resultado es correcto y que no hay errores. Si encuentras un fallo o tienes una sugerencia, escríbenos a [email protected] y lo revisaremos.