Traductor de ADN a proteína
Pega una secuencia de ADN o ARNm para traducirla a proteína en los seis marcos de lectura. Los codones de parada y de inicio se resaltan, se marca el marco abierto de lectura más largo y puedes ver el transcrito de ARNm y una vista codón por codón.
Última actualización:
Traducción en seis marcos
Vista de codones
Transcripción
Cómo usar Traductor de ADN a proteína
- Pega tu secuencia de ADN o ARN. Los encabezados FASTA, los espacios, los números y los saltos de línea se ignoran.
- Elige el código genético (Estándar para genes nucleares de la mayoría de los organismos) y la salida de 1 o 3 letras.
- Lee los seis marcos. Los asteriscos rojos o Stop marcan los codones de parada, la M verde marca los inicios con metionina y el tramo sombreado es el ORF más largo de ese marco.
- Abre un marco en la vista de codones para ver cada codón alineado con su aminoácido y su posición.
- Copia o descarga un marco, el ORF más largo o los seis marcos en formato FASTA.
Del ADN a la proteína: transcripción y traducción
La hebra codificante de un gen se copia en ARN mensajero (transcripción), con uracilo (U) en lugar de timina (T). Después, los ribosomas leen el ARNm de tres en tres bases (traducción). Cada codón de tres letras representa uno de los 20 aminoácidos o una señal de parada. Con cuatro bases hay 4 × 4 × 4 = 64 codones, así que la mayoría de los aminoácidos tienen más de un codón. La traducción suele empezar en AUG (metionina) y termina en el primer codón de parada en el marco: UAA, UAG o UGA.
Como la herramienta lee directamente la hebra codificante, traducir el ADN da la misma proteína que traducir su ARNm. Los marcos −1 a −3 se leen del complemento inverso, que es la hebra opuesta escrita en sentido 5'→3'.
Código genético estándar (tabla 1 del NCBI)
| Aminoácido | 3 letras | 1 letra | Codones de ADN |
|---|---|---|---|
| Alanina | Ala | A | GCT, GCC, GCA, GCG |
| Arginina | Arg | R | CGT, CGC, CGA, CGG, AGA, AGG |
| Asparagina | Asn | N | AAT, AAC |
| Ácido aspártico | Asp | D | GAT, GAC |
| Cisteína | Cys | C | TGT, TGC |
| Glutamina | Gln | Q | CAA, CAG |
| Ácido glutámico | Glu | E | GAA, GAG |
| Glicina | Gly | G | GGT, GGC, GGA, GGG |
| Histidina | His | H | CAT, CAC |
| Isoleucina | Ile | I | ATT, ATC, ATA |
| Leucina | Leu | L | TTA, TTG, CTT, CTC, CTA, CTG |
| Lisina | Lys | K | AAA, AAG |
| Metionina (inicio) | Met | M | ATG |
| Fenilalanina | Phe | F | TTT, TTC |
| Prolina | Pro | P | CCT, CCC, CCA, CCG |
| Serina | Ser | S | TCT, TCC, TCA, TCG, AGT, AGC |
| Treonina | Thr | T | ACT, ACC, ACA, ACG |
| Triptófano | Trp | W | TGG |
| Tirosina | Tyr | Y | TAT, TAC |
| Valina | Val | V | GTT, GTC, GTA, GTG |
| Stop (parada) | Stop (parada) | * | TAA, TAG, TGA |
Consejos para encontrar el marco de lectura correcto
- Busca el ORF largo. En una secuencia aleatoria aparece un codón de parada aproximadamente cada 21 codones (3 de 64), así que es poco probable que un ORF de cientos de codones sea casualidad.
- Comprueba la hebra. Si el ORF largo está en el marco −1, −2 o −3, el gen está en la hebra opuesta. Usa la herramienta de complemento inverso de ADN para invertirla.
- Los genes mitocondriales a menudo parecen rotos con el código estándar porque allí TGA significa triptófano. Cambia a la tabla 2 (vertebrados) o 5 (invertebrados).
- Los genes bacterianos pueden empezar con GTG o TTG. Marca "Codones de inicio alternativos" con la tabla 11 para incluirlos.
- La vista de codones ayuda cuando revisas una mutación puntual: busca el número de posición y mira exactamente qué codón cambió.
Preguntas frecuentes
¿Cómo se traduce el ADN a proteína?
Lee la hebra codificante de tres en tres bases desde una posición inicial elegida. Cada codón de tres bases se busca en el código genético para obtener un aminoácido, por ejemplo ATG = Met (M), TGG = Trp (W) y TAA, TAG y TGA = parada. La herramienta cambia T por U en la vista de ARNm, pero los aminoácidos son los mismos.
¿Qué son los seis marcos de lectura?
Una secuencia de ADN puede leerse en tres marcos en la hebra dada, empezando en la base 1, 2 o 3 (+1, +2, +3), y en tres marcos en la hebra opuesta, que es el complemento inverso (−1, −2, −3). Normalmente solo un marco codifica la proteína real, por eso se usa la traducción en seis marcos para encontrarlo.
¿Qué es un marco abierto de lectura (ORF)?
Un ORF es un tramo que empieza con un codón de inicio (ATG, Met) y continúa sin codón de parada hasta llegar a uno. Los ORF largos son buenos candidatos a genes codificantes de proteínas. La herramienta marca el ORF más largo de ATG a parada en cada marco y te permite copiarlo.
¿Qué significa X en la secuencia de proteína?
X significa que no se puede determinar el aminoácido, ya sea porque el codón contiene un código de ambigüedad (como N) que podría dar aminoácidos distintos o porque el codón está incompleto. Si todas las bases posibles dan el mismo aminoácido, por ejemplo GCN = Ala, la herramienta lo muestra igualmente.
¿Qué código genético debo elegir?
Usa el código Estándar (tabla 1 del NCBI) para genes nucleares de animales, plantas y hongos, y la tabla 11 para bacterias, arqueas y plástidos (mismos aminoácidos, distintos codones de inicio). Los genes mitocondriales usan sus propias tablas, por ejemplo la tabla 2 para las mitocondrias de vertebrados, donde TGA codifica Trp y AGA/AGG son de parada.
¿Puedo pegar una secuencia de ARN?
Sí. U y T se tratan igual, así que las secuencias de ARNm se traducen directamente. El panel de transcripción muestra tanto la hebra codificante de ADN como el ARNm.
¿Mi secuencia se envía a un servidor?
No. La traducción ocurre en tu navegador, así que las secuencias inéditas o confidenciales se quedan en tu dispositivo.
¿Se prueban todas las herramientas de FreeToolCabin para comprobar su calidad y precisión?
Sí. Cada herramienta del sitio pasa pruebas automáticas en navegadores reales para comprobar que el resultado es correcto y que no hay errores. Si encuentras un fallo o tienes una sugerencia, escríbenos a [email protected] y lo revisaremos.